鲐鱼，又名日本鲭（Scomber japonicus），隶属于鲈形目，鲭科；广泛分布于西北太平洋沿岸水域，包括中国各海区，以及日韩朝等国海域。鲐鱼是我国最重要的经济鱼类之一，产量高，经济价值巨大；多年来，其产量居我国所有海水鱼类捕捞产量的第四位（约占总产量的6％）；仅2010年的产量即达49.2万吨。鲐鱼不仅为国内民众提供优质的蛋白质来源，也为我国出口创汇做出重要贡献。种群结构的知识对于正确的评估和管理资源是必不可少的，然而，迄今对于鲐鱼的种群结构信息知之甚少，这不利于鲐鱼资源的有效管理和合理利用。从国际层面上说，鲐鱼是跨界洄游性鱼类，是中国、日本、韩国、朝鲜等国共同捕捞的对象，开展鲐鱼等重要经济鱼类的种群属性研究，可为涉外渔业谈判提供科学依据，对维护我国海洋和渔业权益有一定的意义。
由中国水产科学研究院东海水产研究所程起群博士承担，依托中国科学院昆明动物研究所杨君兴研究组的遗传资源与进化国家重点实验室开放课题“鲐鱼的种群形态变异和遗传分化研究”，通过对采自中国东海和南海6个群体（浙江台州、福建三沙、东山、广东珠海、海南清澜、三亚）的169个个体的11个微卫星位点进行分析，结果显示，群体内的遗传变异水平较高(He=0.651–0.732)，群体间有中等水平的遗传分化(FST=0.0647, P<10-4)。东海和南海也许存在两个不同的种群（stock）：一个种群包括东海所有的、以及延伸到南海海南岛东部的群体；另一个种群包括海南岛南部的一个群体（三亚群体）。鲐鱼东海群体呈现出较高的基因流和有优先性的洄游扩散模式。