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研究分离得到嗜盐古菌质粒新类型
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记者从中科院昆明植物研究所获悉,该所研究员杨祝良指导的博士生陈绍兴等日前从嗜盐古菌中分离到一种新型质粒,将其命名为pHRDV1。研究认为,该质粒代表了嗜盐古菌质粒的一种新类型。该研究成果近日在线发表于《极端微生物》。
据介绍,古菌是生活在极端自然环境的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群,主要分布于各种高盐环境,在医药和化工等方面具有应用前景。研究嗜盐古菌质粒能为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。
“我们从29株嗜盐古菌中分离到新型质粒pHRDV1,并对该质粒进行了基因组测序,开展了生物信息学预测分析和分子遗传学特征鉴定研究。”陈绍兴说,研究表明该质粒的基因组大小为13053碱基对,共有19个开放阅读框,组成两个头对头转录方向的操纵子结构。
不可思议的是,在其基因组上具有三个类似于嗜盐古菌多形病毒特征性蛋白基因,依据该特征,质粒pHRDV1可被归为嗜盐古菌多形病毒II型,同时还具有该型病毒不具备的复制蛋白基因。
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